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隨著技術(shù)的發(fā)展，2016年第三代測序技術(shù)診斷遺傳病初顯成效，國內(nèi)從事第三代測序的企業(yè)也開始做進一步布局，希望能夠全面開啟第三代測序技術(shù)在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的創(chuàng)新應(yīng)用。

在過去的2016年，第三代測序獲得了完美突破，首次登上了太空，首次完成人類基因組測序，首次確定了第二代測序未能檢測到的致病性大片段缺失突變，最終確診了一種罕見遺傳病......第三代測序也被Science納入2016年十大科學(xué)突破之一。

第三代測序技術(shù)避免了第二代測序讀長短的缺點，在臨床上具有無需PCR擴增、可直接對單個分子進行測序、樣本制備簡單、可直接讀取RNA序列和包括甲基化在內(nèi)的DNA修飾等顯著優(yōu)勢，近年來逐漸被應(yīng)用到各大研究中，在人類基因組研究中也獲得了重大突破。未來幾年隨著第三代測序技術(shù)性能的提升，成本還有進一步下降的空間，對于測序深度的選擇會更加靈活。

PacBio單分子實時測序是當(dāng)前應(yīng)用較為廣泛的第三代測序平臺之一，它具有超長讀長、不需要模板擴增、運行時間較短、直接檢測表觀修飾位點、較高的隨機測序錯誤等特點。2016年，PacBio Sequel系統(tǒng)在確定致病性結(jié)構(gòu)變異上展現(xiàn)出了巨大的潛質(zhì)。

BioRxiv上的文章顯示，西班牙裔男性患有Carney 綜合征，但臨床單基因檢測和全基因組測序結(jié)果均為陰性。研究人員利用 PacBio Sequel系統(tǒng)進行了低覆蓋度的全基因組測序，共發(fā)現(xiàn)了大于50bp的6971個缺失片段和6821個插入片段，通過排查，最終確定了PRKAR1A基因外顯子的2184bp雜合子缺失，該基因也正是Carney綜合征的致病基因。

目前PacBio單分子實時測序技術(shù)已應(yīng)用在基因組組裝、轉(zhuǎn)錄組測序、甲基化分析和基因組重測序等方面，尤其是在基因組組裝和甲基化研究中有著獨特的優(yōu)勢。

2016年6月份，Nature Communications雜志發(fā)表了第一個亞洲人參考基因組“華夏一號”。該項目由暨南大學(xué)粵港澳中樞神經(jīng)再生研究院主導(dǎo)，南加州大學(xué)以及北京希望組生物科技有限公司（以下簡稱“希望組”）等多家單位共同合作完成。在該項目中，研究人員利用PacBio公司的SMRT（ Single Molecule, Real Time）三代測序技術(shù)，結(jié)合BioNano光學(xué)圖譜分析技術(shù)，完成了第一個參考序列級別的亞洲人基因組圖譜，對于中國人群基因組學(xué)研究、遺傳疾病研究、精準(zhǔn)醫(yī)療應(yīng)用等領(lǐng)域具有重要科學(xué)及臨床價值。

2016年10月份，Nature雜志上的研究顯示，國立首爾大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員運用第三代測序PacBio單分子實時測序技術(shù)、GemCodeTM和BioNano等多個平臺，對一名韓國人的基因組（AK1）進行從頭組裝和單倍體型定相信息分析。這是迄今為止發(fā)表的最為連續(xù)的人類基因組組裝，填補了特異人群參考基因組的空白，并確定了結(jié)構(gòu)變異。

第三代測序技術(shù)極大地降低了測序的成本和速度，也越來越得到行業(yè)的認可?；驕y序是實現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療的有力武器，目前單分子測序平臺可以廣泛應(yīng)用于無創(chuàng)產(chǎn)前診斷、腫瘤早期無創(chuàng)診斷、胚胎植入前遺傳學(xué)篩查、病原體檢測和遺傳病基因變異檢測等。隨著技術(shù)的發(fā)展，2016年第三代測序技術(shù)診斷遺傳病初顯成效，國內(nèi)從事第三代測序的企業(yè)也開始做進一步布局，希望能夠全面開啟第三代測序技術(shù)在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的創(chuàng)新應(yīng)用。

希望組積累了豐富的第三代測序生物信息分析經(jīng)驗。近日，希望組向PacBio采購五臺Sequel測序儀，在進一步提高動植物基因組學(xué)研究效率之外，還致力于加快其在人類基因組結(jié)構(gòu)變異分析、動態(tài)突變疾病檢測、全長HLA高分辨率分型技術(shù)等方向的研發(fā)工作。

希望組CEO汪德鵬先生對未來充滿信心，“過去幾年中，我們完成了近千個三代測序項目，與國內(nèi)知名臨床機構(gòu)和遺傳病專家進行研發(fā)合作，并且與PacBio建立了戰(zhàn)略合作關(guān)系，這都將成為我們下一步戰(zhàn)略的基礎(chǔ)。構(gòu)建一定規(guī)模的三代測序平臺，是我們大量合作項目的內(nèi)在需求，但是，我們并不會把構(gòu)建“測序工廠”作為主要目標(biāo)，而是會全力以赴的專注在三代測序在遺傳病診斷領(lǐng)域的應(yīng)用創(chuàng)新?！?