一本之道av不卡精品|91国语露脸精品国产|国产精品无码专区第一页|久久综合东京热精品丝袜|亚洲精品快活在线观看网站|99无码熟妇丰满人妻啪啪|精品久久久久久久久无忧传媒|久99在线热这里只有精品视频

400-831-9099

新聞動態(tài)

一文讀懂：NGS如何指導(dǎo)臨床診斷、治療和預(yù)后？

發(fā)布時間：2016-09-01作者：諾為爾基因瀏覽次數(shù)：3330

一文讀懂：NGS如何指導(dǎo)臨床診斷、治療和預(yù)后？

 

一文讀懂：NGS如何指導(dǎo)臨床診斷、治療和預(yù)后？.jpg 


時光荏苒，距Franklin，Watson和Crick發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)已經(jīng)過去60余載，距人類基因組計劃完成也已有十年之久。大規(guī)模高通量測序時代下，新一代測序技術(shù)(NGS)猶如上帝之眼，讓人類重新認識和分類疾病。下面就以急性髓性白血病為例，來看看NGS是如何指導(dǎo)治療和判斷預(yù)后的。 


1急性髓性白血病起源


急性髓性白血?。ˋcute Myeloid Leukemia，AML）由未分化的粒細胞前體惡性克隆擴增而成，從而導(dǎo)致患者造血功能障礙和骨髓功能衰竭。白細胞生成過程中，在骨髓干細胞分化為成骨髓細胞階段，突變基因?qū)е录毎惓７只瑥亩赡馨l(fā)展成急性髓性白血病。由于在這個動態(tài)分化發(fā)育過程中，任何階段的細胞惡性變化都會發(fā)展成AML，因此AML腫瘤細胞具有高度異質(zhì)性。之前的研究發(fā)現(xiàn)相對于其他癌癥，急性髓性白血病涉及的突變基因數(shù)目要少得多，這個特點增加了科研過程中的針對性。

圖1 急性髓性白血病的起源jpg
圖1 急性髓性白血病的起源


2TCGA全面研究AML


2013年癌癥基因組圖譜（TCGA），從隊列研究中選取了200位AML成人患者為研究對象。取患者AML成母細胞為體細胞突變研究樣本，以患者自身正常皮膚細胞為配對種系對照。在200組成對樣本中，對其中50組進行全基因組重測序（WGS），150組進行全外顯子測序（WES）。研究組同時也對RNA，microRNA和DNA甲基化進行了分析。


圖2 急性髓性白血病的綜合分析研究思路.jpg

圖2 急性髓性白血病的綜合分析研究思路


研究找出了急性髓細胞白血病致病相關(guān)基因突變。基因分布如圖3所示：轉(zhuǎn)錄因子突變相關(guān)的信號蛋白突變基因；調(diào)節(jié)DNA的甲基化以及相關(guān)的組蛋白的突變基因；調(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的復(fù)合黏連蛋白突變基因；影響mRNA剪切與其形成蛋白的突變基因。

圖3 急性骨髓性白血病突變基因在表達調(diào)控中關(guān)聯(lián)位點.jpg
圖3 急性骨髓性白血病突變基因在表達調(diào)控中關(guān)聯(lián)位點



3根據(jù)AML測序數(shù)據(jù)分類臨床亞型


基于TCGA對AML分子水平全面的多組學研究，包括癌癥基因組計劃在內(nèi)的多個研究機構(gòu)，招募了1540位經(jīng)過強化治療的AML患者。結(jié)合111個癌癥基因的驅(qū)動突變和臨床數(shù)據(jù)，研究分子水平AML亞型分類、病理機制、診斷預(yù)后和臨床指導(dǎo)。76個基因或基因區(qū)域的5234個驅(qū)動突變，其中至少2個驅(qū)動突變廣泛存在于86%患者中。11個亞型被分化出，這些亞型有各自不同的診斷，預(yù)后和療效特征。

圖4 急性骨髓性白血病驅(qū)動突變總覽.jpg
圖4 急性骨髓性白血病驅(qū)動突變總覽


表1  基因水平AML亞型分類

表1 基因水平AML亞型分類,jpg



總結(jié)


基于對大規(guī)模隊列研究樣本的高通量測序，全面的基因?qū)用娴募毙怨撬栊园籽≈R基礎(chǔ)已經(jīng)建立。通過對這些測序數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)分析，11個AML亞型被分類出來。臨床水平上各個亞型的診斷，預(yù)后和療效具有各自特征，這更加證明了NGS在臨床中的應(yīng)用和前景。



參考文獻


[1]D?hner, H., Weisdorf, D. J., & Bloomfield, C. D. (2015). Acute myeloid leukemia. New England Journal of Medicine, 373(12), 1136-1152.

[2]Cancer Genome Atlas Research Network. (2013). Genomic and epigenomicl and scapes of adult de novo acute myeloid leukemia. New England Journal of Medicine, 2013(368), 2059-2074.

[3]Papaemmanuil, E., Gerstung, M., Bullinger, L., Gaidzik, V. I., Paschka, P.,Roberts, N. D., & Gundem, G. (2016). Genomic Classification and Prognosis in Acute Myeloid Leukemia. New England Journal of Medicine, 374(23), 2209-2221.

[4]Hunger, S. P., & Mullighan, C. G. (2015). Acute lymphoblastic leukemiain children. New England Journal of Medicine, 373(16), 1541-1552.